癌症研究
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非酒精性脂肪肝(NAFLD)是一种由于代谢紊乱引起的肝炎,也是肝癌(NASH-HCC)发生的重要来源之一。但是,对于NAFFLD如何向NASH-HCC发展的分子机制还不了解。来自复旦大学医学院的研究人员,通过石蜡包埋样本的检测与后续功能验证,找到了一个肥胖相关基因,KIAA1462(JCAD),在由NAFLD向NASH-HCC发展的过程中发挥了重要作...
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膀胱癌(Bladder cancer)是一种常见的泌尿系统肿瘤,由于易转移,死亡率高,5年生存率只有8.1%。因此,研究膀胱癌的发病机制,有助于对膀胱癌的诊断和治疗。circRNA是一类具有闭合环形结构的非编码RNA,是现阶段转录组学研究的新星。本研究从circRNA的角度出发,深入阐述了一个circRNA在膀胱癌中的作用机制。...
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本研究由伯豪生物协助复旦大学生命学院课题组,发现了与前列腺癌雄性激素相关特异性的circRNA分子,为circRNA在前列腺癌中的诊断和治疗提供了理论基础。
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本研究通过伯豪生物提供的circRNA芯片对正常和接受放疗的肝星状细胞中差异表达的circRNA进行分析,探讨其在放射性肝纤维化发病过程中的作用。
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今天大家就随小编一同来看一篇2017年6月刚发表在Nature Cell Biology杂志上的lncRNA反向遗传学案例。在了解lncRNA在肝癌发生中的生物学作用的同时,也来学习一下lncRNA的反向遗传学研究套路。
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DNA甲基化是一种重要的表观修饰,在肿瘤的起始及进展过程中具有重要的作用。普遍存在的DNA甲基化修饰,为肿瘤的检测及预后判断提供了大量可供选择的分子标记。在全世界范围内,肝癌的发生非常普遍。
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清华大学联合上海东方肝胆医院研究人员通过对20个病人的60个临床样本进行RNA-Seq鉴定到了8603个可能的lncRNA。其中917个lncRNA在TCGA数据库以及发表的肝癌数据库中有关联,235个lncRNA存在CNVs和DNA甲基化变化。很多与lncRNA共表达的基因富集在细胞粘着、免疫反应以及代谢过程等通路上。HAND2-AS1还通过RNAi的敲降进行了部...
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中山大学附属肿瘤医院的科学工作者,采用甲基化芯片在全基因组范围内鉴定了鼻咽癌病人特异的转录因子HOPX。该研究为鼻咽癌诊断提供了新的生物标记,为鼻咽癌的治疗提供了新的靶点。
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在全世界分范围内,每年因肝癌死亡的病例超过50万人,是主要的致死恶性肿瘤之一。在过去的十年中,随着影像学的进步以及健康体检的普及,越来越多的肝癌病人在患病早期被发现。但由于肝脏捐赠者的短缺,外科肝脏切除术仍然是治疗早期肝癌病人的最主要方法。目前对于术后患者缺乏准确预测体系或标志物。本研究建立了一种预测...
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2017年国自然申请的热点什么?circRNA,lncRNA,外泌体。除了这些大家耳熟能详的香馍馍之外,现在很多小伙伴们开始了新的玩法,通过多平台联用,将不同层面的东西结合起来,比如,表观遗传与非编码RNA的结合,就是一个很好的例证。...
免疫系统研究
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DDX46是RNA解旋酶DDX家族成员,对于细胞核内mRNA前体的剪接具有重要的调控作用。《Nature Immunology》杂志8月29日发表了中国医学科学院院长、中国工程院院士曹雪涛研究团队的论文,揭示了RNA解旋酶DDX46通过结合RNA去甲基化酶ALKBH改变细胞核内RNA修饰的新方式,参与调控抗病毒天然免疫应答。这篇文章提出了一种新的天然免...
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系统性红斑狼疮(SLE)是一种复杂的自身免疫性疾病,其发病机制目前还不是很清晰。树突细胞(DCs)在免疫系统中扮演着重要的角色,与SLE的发生关系密切。来自复旦大学附属华山医院的研究人员,以树突细胞为研究对象,深入探究了miRNA在SLE疾病中的重要作用。...
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原发性干燥综合征(pSS)是一种由于外分泌腺紊乱引起的自身免疫性疾病,最典型的临床表现为口眼由于唾液腺和泪腺原因而导致的异常干燥。LncRNA是目前转录组学研究的热点,但是,lncRNA是否与pSS的发病有关,目前还没有相关报道,来自上海第九人民医院的研究人员,通过唾液腺中lncRNA的表达模式研究,阐述了lncRNA在干燥综合...
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CD8+记忆T细胞(TM),与初始T细胞(TN)和效应T细胞(TE)共同组成了免疫反应T细胞,在再次免疫应答中起重要作用。在过去的时间里,对于人源T细胞功能的分子机制研究一直在努力中,如CD8+T细胞能特异性表达下记忆细胞特异性表位markers(CD45RO),以应对刺激下的快速免疫反应。运用高通量基因表达谱芯片,很多研究发现了CD8...
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FOXP3+调节性T细胞(Treg)具有免疫抑制作用,在维持自身免疫过程中具有重要作用。因此,对Treg细胞在体内的分子机制研究也具有重要意义。关于FOXP3+ Treg细胞稳定性的争论从最近的一些工作报道中也是愈演愈烈。在这些研究中,稳定Treg细胞在炎症反应以及成淋巴反应中具有T-effector-cell-like表型,并且发现FOXP3表达不稳...
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自然杀伤(NK)细胞是一类先天性免疫淋巴细胞,与体外病毒感染和免疫调节有关。但是,lncRNA在NK细胞生物学过程中的作用还不是很清楚。研究人员借助于高通量lncRNA芯片检测技术,分析了NK细胞中lncRNA表达模式,发现了调控NK细胞分化和生物学功能相关的lncRNAs。其中,lnc-CD56,作为正调控因子,与CD56的表达呈正相关模式...
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急性红细胞白血病(AEL)是白血病(AML)亚型中的一种,在老年人白血病中的占比较高。相对于其他类型的AML,AEL病人有更加poor-risk的细胞遗传学异常和不良的预后。虽然针对AEL的外显子突变位点发现已有一些报道。但是,针对AEL的完整突变谱发现还没有相关报道。...
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2016年1月19日,国际著名医学期刊《Annals of the Rheumatic Diseases》(影响因子10.377,风湿病领域排名第1)发表中南大学湘雅二医院陆前进教授研究团队对系统性红斑狼疮的研究成果。陆教授团队经过3年的艰苦努力,研究开发出一种特异性高、敏感性强系统性红斑狼疮新型诊断标志物,在国际上首次将对该疾病的诊断提升到基...
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非编码RNA是近年来研究的热点。越来越多的研究表明,lncRNA在肿瘤发生发展过程中发挥着重要作用。除了肿瘤,我们常见的其他非致命性疾病是否也与lncRNA有关呢?今天,小编和大家分享一篇近期在《Journal of Investigative Dermatology》(IF=7.216)发表的关于lncRNAs在牛皮癣中的表达及可能的调控机制。...
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在寻找疾病相关基因的研究中,使用基因芯片对家系进行连锁分析,将基因定位于少数几个区域中,接着进行外显子组测序或全基因组重测序寻找候选区域中的遗传变异,是一个准确高效的研究方案
神经系统研究
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外周神经系统(PNS)损伤后的修复涉及到非常复杂的生物学功能。壳聚糖作为一种人工神经导管,在治疗PNS修复过程中有非常显著的效果。当然,在这个过程中,壳聚糖的作用不仅仅是作为神经修复的支架,其降解产物壳寡糖(COS)是具有促进组织再生功能的。然而,目前这种现象的具体作用机制还不是很清楚。本研究组之前的研究发...
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阿尔茨海默氏症(Alzheimer'sdisease,AD)是一种神经性疾病。有研究表明,miRNA-Seq和全基因组测序鉴定到了一些非编码RNA可能参与了其中的疾病形成。
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研究人员发现锌指转录因子——Sp9,在LGE祖细胞中广泛表达,对维持有丝分裂期后的纹状体苍白球MSNs至关重要,为我们理解神经元发育过程提供了新的证据。
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与疾病发生相关的特异性非编码RNA鉴定方法多样,怎么样结合生物信息学数据和实验数据挖掘与疾病特异性的非编码RNA筛选呢?今天,小编和大家分享一篇最近发表子《Scientific Reports》上的研究,来了解下怎么样筛选与神经发育和智力障碍相关的特异性lncRNA分子。...
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最新一代全转录本表达谱芯片——HTA2.0芯片,科研人员是怎么样运用到实际科研中呢?今天,小编和大家分享一篇由华中科技大学为第一研究单位发表在著名杂志《Nature》上的有关自身免疫性疾病研究报道
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在神经网络中,外部刺激通过背根神经节(Dorsal root ganglion,DRG)的假单极感觉神经元(Pseudo-unipolar sensory neurons)传递到脊髓(Spinal cord)中。小的DRG可以通过无髓鞘的轴突(Un myelinated axons,C-fibers)和薄髓鞘的轴突(thinly myelinated axons,Aδ-fibers)传递从神经末梢(Peripheral nerve termina...
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多发性硬化(Multiple sclerosis,MS)是一种以中枢神经系统白质脱髓鞘和神经退行性变为主要病理特点的神经免疫性疾病和神经退行性疾病,是青壮年致残率最高的非创伤性神经疾病。
其他疾病研究
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足细胞是位于肾小球毛细血管基底膜外侧的脏层上皮细胞,因其胞浆在基底膜表面形成伪足样突起而得名。足突之间的裂孔膜是肾小球滤过的最后一道屏障,因此足细胞损伤将导致蛋白尿出现。足细胞损伤是肾小球性蛋白尿发生的主要机制,与多种肾小球疾病的发生发展密切相关。组蛋白去乙酰化酶Sirt6对多种细胞类型和组织起生理学作...
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Folic Acid(FA, 叶酸),在促神经管发育等方面的作用而被广大备孕青年们使用。然而,除了这方面的用处外,现在的研究也发现,叶酸可以预防肥胖引起的心血管和代谢异常。但是,其中的内在分子机制是什么?本研究就是通过小鼠模型,高脂喂育加叶酸下,小鼠心脏中lncRNA和mRNA的变化分析,解释了叶酸对胖子们心血管方面的影响。...
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本研究从检测血清外泌体中的miRNA入手,筛选了可用于KD特异性诊断biomarker的潜在分子。
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烟雾病(MMD)是一种原因不明、慢性进行性的脑血管闭塞性疾病,主要表现为单侧或双侧颈内动脉远端大脑中动脉和大脑前动脉近端狭窄或闭塞伴脑底部和软脑膜烟雾状、细小血管形成。临床表现主要有脑缺血、脑出血及癫痫等。目前对于MMD的发病机理还不清楚,因此,挖掘与MMD发病相关的功能基因有助于MMD的诊断与治疗。本研究从ln...
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糖尿病是一种能量代谢内稳态紊乱性疾病,且已经达到了流行病的程度。以RYGB和VSG为代表的减肥手术是目前治疗二型糖尿病的有效手段,但其机制尚未明确。肠道尤其是十二指肠作为消化、吸收、内分泌器官在减重手术中发挥了重要作用。...
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每一个科研领域的小伙伴们,所在的科室,实验室都会有一个研究的方向。那么,我们的目的就是从分子角度去选择一个点,来解释这个问题。问题很简单,相对正常,脂肪肝模型中有哪些特异性表达的分子,他们怎么就影响了脂肪肝的形成。...
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骨髓是高度异质化和血管化的组织,各类型细胞相互交流以保证骨骼正常发育。哺乳动物骨骼发育过程,骨生成与血管生成通过成骨细胞与内皮细胞间的相互交流而密切联系。但参与调节骨生成和血管生成的分子机制及其信号通路尚不明确,因此研究成骨细胞与内皮细胞交流的关键分子尤为重要。来自南方医科大学的研究人员,通过他们的...
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ESC在体外可无限自我更新和分化为机体内任何种类的细胞,在器官再生和细胞替代治疗中具有广阔的应用前景。然而,hESC维持自我更新及发育多能性的分子调控机制还有很多问题尚不清楚,妨碍了将其分化的细胞安全有效地应用于临床。因此,对人ESC如何维持其自身特性的机制进行深入的研究尤为重要。...
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全世界范围内,卒中严重降低其患病者的生存质量。而缺血性卒中占整个卒中的70-85%。快速诊断对超急性期脑梗死的临床决策非常重要。人们逐渐把寻找生物标志物的方向投向循环血的miRNA。但脑梗死病因复杂,分类繁多,使寻找特异性和敏感性高的循环血miRNA标志物困难重重。本研究使用miRNA的芯片及定量PCR数据来判定miRNA对超...
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寨卡病毒(Zika virus,ZIKV)是一种单链RNA病毒,可通过蚊子进行人类之间的传播。可引起无症状传染或者温和病症,包括发热,身体不适,发疹以及结膜炎,极少数会通过损害周围神经系统引发急性感染性多发性神经炎(Guillain-Barre syndrome )。...
动物研究
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斜纹夜蛾(Spodoptera litura, S. litura)是来源于印度的谷物类害虫,属鳞翅目类昆虫,目前在多个国家都有广泛的分布。核型多角体病毒(nucleopolyhedrovirus, NPV)可寄生于鳞翅目昆虫的血、脂肪、氯管、皮肢等细胞的细胞核内发育,对其产生致命影响。...
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《Comparative Biochemistry and Physiology Part D: Genomics and Proteomics》杂志报导了安徽农业大学植保学院的研究人员在昆虫转录组测序方面的研究论文,该课题组利用第二代高通量测序技术对黄粉甲触角组织进行转录组测序,并鉴定出数十条编码嗅觉蛋白的基因。安徽农业大学植保学院的刘苏博士和李世广博士分别是本文的...
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攻击行为是很多物种共有的进化属性,它可以帮助雄性物种快速建立生存空间或社会主导地位。然而可想而知,这种属性在禽类的饲养中是十分不利的。
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肝脏是一个重要的代谢器官,它在脂类合成、降解以及转运过程中都发挥着极其重要的作用,然而,鸡的脂类代谢的分子调控机制至今仍不清楚。
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国际学术期刊《Cell Research》在线发表了由中科院动物所和中科院生化细胞所共同完成的在小鼠生精细胞发生中MIWI/piRNA的功能机制的研究论文,报道了在小鼠睾丸中piRNA发挥着类似siRNA的功能,可以指导MIWI对于mRNA的剪切,保证小鼠配子的正常生成。本项研究工作是由中科院北京动物研究所何顺明实验室、上海生物化学及细胞...
植物研究
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研究证明,E族PPR蛋白dek10对nad3和cox2的位点编辑至关重要,而这在植物发育过程中是必不可少的。
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沙梨(学名:Pyrusserotina)蔷薇科梨属落叶乔木。果圆形,有时长圆形或卵形,果皮锈色或绿色者,一般无蒂。果实、果皮:清热,生津,润燥,化痰。根:止咳嗽。
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该研究与前几天RNA测序在玉米籽粒dek2突变体中分子机制的研究应用相似,研究的主角依然是上海大学生命科学学院,该工作主要由陈鑫泽博士完成。研究对象由dek2突变体变为了dek35突变体。
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2017年1月1日遗传学期刊Genetics(影响因子4.6)在线发表了上海大学生命科学学院祁巍巍老师的有关玉米突变体基因克隆与功能分析新文章。
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研究首次系统的考察了与毛白杨性别特异性花相关的miRNA以及它们的靶基因,加深了我们对miRNA在毛白杨雄花和雌花形成中所起的调控作用的认识。
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芥菜型油菜作为一种广泛种植的作物,能产生不同颜色的种子。种子的着色是由于内皮细胞原花色素(proanthocyanidins,PA)的沉积,该终产物是通过一条类黄酮化合物合成的途径形成。
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脱落酸(ABA)是一类重要的植物激素,调控植物的种子休眠、气孔开关、叶片脱落等生理过程,在保护植物应对干旱等逆境中具有至关重要的作用。 ABA作为一种植物压力激素,在促进植物在压力条件下的生存和生长方面的重要地位不容忽视。过去基于基因表达的研究主要集中于短期ABA处理下植物的反应,然而对于持续ABA处理下的变化...
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上海大学的研究人员通过对Opaque2的酵母双杂交(Yeast two-hybrid screening)技术对其互作蛋白进行筛选以及功能分析,从而对Opaque2调控下游基因的表达的理论模型做出了进一步的解释和完善。
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RNA沉默是真核生物中调控基因表达的一种保守机制,它在植物生长发育和抗病毒中发挥着重要的作用。RNA病毒进入寄主植物细胞后,其复制中间复合体和单链基因组RNA的高级结构形成的双链RNA可以被寄主植物DCL蛋白识别,加工产生21-24-nt的初级来源于病毒的siRNA(vsiRNA)。...
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玉米是重要的粮食、饲料和能源作物。玉米籽粒的发育状况对玉米产量及质量有着直接影响,玉米籽粒突变体的形成机制及其突变基因的功能机理研究对作物改良育种具有重大意义。
微生物研究
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本研究作者通过对格尔德霉素(geldanamycin)产生菌Streptomyces hygroscopicus (S. hygroscopicus)XM201进行基因组测序和转录组测序,找到了格尔德霉素生物合成的关键限速步骤,并通过对关键限速步骤中基因的启动子用内源性强启动子替换的方式,使格尔德霉素的产量得到了很大程度的提高。...
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土壤退化是一个及其严重的全球问题,长期连作和滥用化肥会造成土质变差。全球范围内,每年约有40%的农业土壤发生严重退化,24%的土壤仍在持续恶化。在中国,农业化肥的滥用导致土壤退化,造成土壤养分失衡、土壤酸化、污染物积累和生物多样性下降等现象。但是关于土壤微生物群落对土壤退化及生态系统功能的反馈机制仍知之甚...
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该研究首次完成该厌氧菌的全基因组精图及注释,并发现与其主要产物合成相关关键基因,为后续代谢工程改造奠定基础。
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上海交通大学生命科学技术学院、微生物代谢国家重点实验室在DNA磷硫酰化修饰研究方面取得新进展,由德林教授研究小组与美国麻省理工学院Peter C. Dedon教授课题组合作,博士生曹博为第一作者,在分子微生物学领域权威期刊《Molecular Microbiology》上发表研究性论文,揭示了DNA磷硫酰化修饰依赖的限制系统的作用机理,阐明...
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结核分枝杆菌是最成功的胞内病原体之一。其在感染宿主时能够被巨噬细胞所吞噬,进而形成吞噬体。吞噬体可以进一步的破坏入侵的病原体。但是结核分枝杆菌可以通过一系列的过程来避免吞噬体的消灭,进而来破坏宿主细胞。...
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γ丁内脂(γ-butyrolactone简称GBL)生物合成基因afsA和GBL受体基因arpA的两对同系物位于吸水链霉菌基因组的不同位置。井冈霉素是一种重要的抗菌抗生素,同时也是抗糖尿病药物合成的关键底物
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厌氧消化被认为是一种最重要、有效稳定的处理和回收污染的活性污泥,牲畜粪以及其他有机废水和固体废物的方法。有机物质可以通过厌氧消化过程被最大程度的转化成沼气,但是,剩余在沼渣沼液或发酵液中的矿物质和其他......
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该文以基因芯片为手段,揭示了恰塔努加 链霉菌一个多效调控蛋白 SprA 的作用机制。浙江大学生命科学学院的博士生周 振兴和李永泉教授分别为本文的第一作者和通讯作者。